长江南京航道局是具有行政管理职能的公益性事业单位，负责长江干线浏河口至上巢湖818.6公里航道的规划、建设、管理、养护工作。具体职责：

一、 贯彻落实国家有关交通运输行业的法律法规、方针政策及长江航道局发展战略；

二、 负责参与制订辖区航道建设发展总体规划和中长期发展规划，编制和上报辖区航道养护生产的年度计划；

三、 负责辖区航道养护性疏浚及相关整治工程的协调与配合工作；

四、 负责辖区航道、航标的养护与管理和航道测绘管理以及航道整治物的维护管理工作；

五、 负责辖区航道、航标及其设施的保护；负责或参与辖区内与通航有关设施通航论证、标准和技术要求的审查；负责辖区专设航标的行政许可；对辖区破坏航道、航标及其设施的行为进行管理；负责辖区航道行政管理工作及现场执法活动；

六、 负责辖区航道技术研究和航道演变分析工作；

七、 负责单位劳动工资、机构编制、人员管理工作；负责单位改革、法制建设工作；负责单位国有资产管理、财务管理和审计监督工作；负责单位的安全监督工作；负责科技管理工作；

八、 负责单位精神文明建设、党组织建设、廉政建设工作；负责单位工会、共青团等群团工作。

九、 完成上级交办的其他工作。